Un atlas spatial MOSAIC des cellules cancéreuses sera également créé

Owkin, NanoString Technologies et les instituts de recherche sur le cancer University of Pittsburgh, Gustave Roussy, Lausanne University Hospital, Uniklinikum Erlangen/Friedrich-Alexander- Universität Erlangen-Nürnberg et Charité – Universitätsmedizin Berlin lancent MOSAIC (Multi Omic Spatial Atlas In Cancer) à l'American Réunion annuelle de la Société d'oncologie clinique.

MOSAIC est un projet de 50 millions de dollars visant à révolutionner la recherche sur le cancer grâce à l'utilisation de l'omique spatiale, un ensemble de technologies qui offrent des informations sur la structure des tumeurs.

L'omique spatiale permet aux chercheurs d'examiner les tumeurs à une résolution proche d'une seule cellule, tout en révélant l'emplacement et l'activité moléculaire des cellules tumorales et immunitaires. Il fournit une carte détaillée des interactions moléculaires, permettant aux scientifiques de déchiffrer les relations clés entre une tumeur et son environnement.

En générant et en analysant des données spatiales omiques en combinaison avec des données multimodales sur les patients et l'intelligence artificielle, MOSAIC vise à débloquer la prochaine vague de traitements pour certains des cancers les plus difficiles à traiter.

Première initiative de ce type utilisant la technologie des omiques spatiales, Owkin a déclaré que MOSAIC a le potentiel d'ouvrir un nouveau domaine dans la recherche sur les traitements en oncologie. Owkin investira 50 millions de dollars pour construire MOSAIC. Il utilisera 7 000 échantillons de tumeurs de patients, ce qui le rend plus de 100 fois plus volumineux que tous les ensembles de données spatiales omiques existants. Owkin et les partenaires de MOSAIC exploiteront cette ressource pour les sous-types de maladies immuno-oncologiques à la recherche de biomarqueurs et de nouvelles thérapies.

Thomas Clozel, co-fondateur et PDG d'Owkin, a déclaré : « La convergence des omiques spatiales, des données patient multimodales et de l'IA alimentera la prochaine révolution dans la recherche en oncologie, débloquant la prochaine vague de traitements révolutionnaires pour les patients. MOSAIC nous aidera , et nos partenaires réalisent des percées sans précédent dans la lutte contre le cancer."

Brad Gray, président et chef de la direction de NanoString, a déclaré : « Ce projet a le potentiel de transformer notre compréhension de la biologie du cancer et de déclencher le développement de nouveaux diagnostics et thérapeutiques. Il s'agit d'une collaboration sans précédent, réunissant les puissantes plateformes de biologie spatiale de NanoString, la plus haute qualité des échantillons de cancer cliniquement annotés provenant des meilleurs centres de recherche sur le cancer, et la technologie et les analyses extraordinaires d'Owkin en matière d'IA. »

Robert Ferris, vice-chancelier associé pour la recherche sur le cancer et professeur Hillman d'oncologie à la faculté de médecine de l'Université de Pittsburgh et directeur de l'UPMC Hillman Cancer Center, a déclaré : « L'Université de Pittsburgh est ravie de faire partie des consortiums MOSAIC, qui tirez parti de notre expertise spatial-omique de l'UPMC Hillman Cancer Center pour comprendre les cellules cancéreuses dans leur environnement. Nous sommes enthousiastes à l'idée de travailler avec d'autres universités et partenaires industriels pour découvrir des informations exploitables pour détecter, traiter et prévenir le cancer.

Le profilage moléculaire à résolution spatiale (également connu sous le nom d'omiques spatiales), reconnu comme méthode de l'année par Nature Methods, est un groupe de technologies avancées pour quantifier et localiser l'expression moléculaire qui offre aux scientifiques une vue des structures tumorales à une résolution proche de celle d'une seule cellule, révélant interactions entre les cellules tumorales et non tumorales.

En mesurant l'expression d'une molécule et en la cartographiant à son emplacement dans l'échantillon de tumeur, l'omique spatiale permet aux chercheurs de "zoomer" sur l'hétérogénéité tumorale, la communication cellule-cellule et les interactions tumeur-système immunitaire. Cette approche innovante est destinée à catalyser des percées scientifiques sans précédent et à transformer notre compréhension fondamentale des mécanismes de la maladie.

Suite à l'analyse des données des patients des centres de recherche utilisant la technologie d'omiques spatiales de NanoString, combinée à l'ARN-seq, à la protéomique, à l'histologie et à d'autres données médicales, Owkin développera une plate-forme de données et utilisera l'apprentissage automatique, y compris les réseaux de neurones profonds, pour découvrir une nouvelle biologie du cancer et les thérapies potentielles.

MOSAIC se concentrera initialement sur plusieurs cancers dont les besoins médicaux ne sont pas satisfaits, notamment le cancer du poumon non à petites cellules, le cancer du sein triple négatif, le lymphome diffus à grandes cellules B, le cancer de l'ovaire, le glioblastome, le mésothéliome et le cancer de la vessie. Après une période de recherche initiale, MOSAIC et ses méthodes normalisées de génération et d'analyse de données seront rendus accessibles à la communauté biomédicale mondiale, propulsant davantage les progrès de la recherche en oncologie.

L'échelle de MOSAIC dépasse de manière significative les études spatiales omiques existantes. Les efforts antérieurs sont trop petits de deux ordres de grandeur pour conduire à des percées. Actuellement, la plupart des études impliquant ces modalités de données sont limitées par la taille des échantillons, généralement inférieure à 50. En revanche, MOSAIC analysera les données de 7 000 patients, permettant aux scientifiques de mener des recherches sur des cohortes de données 100 fois plus importantes que ce qui est actuellement possible.